ספוגית הלוע היא מעין בדיקת חומצות גרעין. הפעולה של משטח גרון פשוטה יחסית. זה כולל בעיקר ספוגית אף וספוגית פה-לוע. באופן יחסי, שיעור הזיהוי של ספוגית אף-לוע גבוה יותר בגלל הפרשות מהאף. העומס הנגיפי גבוה יחסית מהעומס הנגיפי של הפרשות אורו-לוע.
בנוסף, האף-לוע משמש לאיסוף הפרשות. המפעיל יכול לעמוד בצד המטופל ולהביט ישירות בפה ובחלל האף של המטופל, והסיכון לחשיפה נמוך. אם נעשה שימוש בספוגית אורופרינג לזיהוי, על המפעיל לעמוד מול המטופל. בצד הנגדי, ההפרשות והזיהום הנפלטים בקלות מהקיא או הרפלקסים של המטופל' מגבירים את הסיכון לזיהום.
