מכיוון שקצה המסנן הוא קצה מסנן חד פעמי, התפקיד הגדול ביותר בתהליך השימוש הוא למנוע זיהום צולב. בניגוד לסוגי פילטרים אחרים המכילים תוספים שיכולים לעכב תגובות אנזימטיות, קצות הפיפטה לסינון רקמות ביולוגיות עשויות מפוליאתילן סינטר בתולי. חלקיקי פוליאתילן הידרופוביים מונעים משיכת אירוסולים ונוזלים לפיפטה.
המסנן של קצה המסנן נטען במכונה כדי להבטיח שהקצה אינו מושפע לחלוטין במהלך תהליך הייצור והאריזה. הם מאושרים ללא זיהום RNase, DNase, DNA ופירוגן. בנוסף, כל המסננים עוברים עיקור קרינה מראש לאחר האריזה להגנה משופרת על דגימות ביולוגיות.
השימוש בקצות מסנן יכול לשמש כדי למנוע מהפיפטה להיפגע מהדגימה, מה שמשפר מאוד את חיי הפיפטה.
